Z03388 GenCrispr Cas9基因編輯系統(tǒng)是基于CRISPR-Cas9技術(shù)的定制化工具,通過引導(dǎo)RNA(gRNA)靶向特定DNA序列,利用Cas9核酸酶切割雙鏈DNA,實(shí)現(xiàn)基因敲除、敲入或修飾,在疾病模型構(gòu)建、作物育種及藥物靶點(diǎn)篩選中應(yīng)用廣泛。但其操作復(fù)雜,需從以下核心環(huán)節(jié)深入理解。
一、核心原理:
CRISPR-Cas9系統(tǒng)的“導(dǎo)航儀”是gRNA(與目標(biāo)DNA序列互補(bǔ)配對,通常20nt左右),“剪刀”是Cas9蛋白(識別PAM序列,原核生物中常見NGG)。當(dāng)gRNA引導(dǎo)Cas9結(jié)合到目標(biāo)位點(diǎn)后,Cas9的核酸酶結(jié)構(gòu)域(RuvC和HNH)切割DNA雙鏈,產(chǎn)生平末端或粘性末端缺口。細(xì)胞自身的DNA修復(fù)機(jī)制(非同源末端連接NHEJ或同源重組修復(fù)HR)會修復(fù)切口——NHEJ易引入插入/缺失突變(Indel),實(shí)現(xiàn)基因敲除;HR則可通過提供供體模板(Donor DNA)插入或替換特定序列(如熒光蛋白基因或突變位點(diǎn))。

二、關(guān)鍵步驟:
•靶點(diǎn)設(shè)計(jì):用在線工具(如CRISPR Design Tool)篩選gRNA靶序列(需避開脫靶位點(diǎn),優(yōu)先選擇GC含量40%-60%、位于外顯子編碼區(qū)的序列),并通過生物信息學(xué)預(yù)測脫靶風(fēng)險(xiǎn)(如Off-target Finder)。
•載體構(gòu)建:將gRNA表達(dá)框(含U6啟動子)與Cas9蛋白表達(dá)框(含CMV或EF1α啟動子)克隆至質(zhì)粒載體(如pX330或lentiCRISPRv2),或直接使用預(yù)包裝的慢病毒/腺相關(guān)病毒(AAV)顆粒(適合難轉(zhuǎn)染細(xì)胞)。
•細(xì)胞轉(zhuǎn)染:通過脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染(如Lipofectamine 3000)、電穿孔或病毒感染將編輯載體導(dǎo)入目標(biāo)細(xì)胞(如HEK293T、原代神經(jīng)元),轉(zhuǎn)染效率需>70%(通過熒光標(biāo)記質(zhì)粒預(yù)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證)。
•編輯驗(yàn)證:提取基因組DNA,用PCR擴(kuò)增目標(biāo)區(qū)域(引物設(shè)計(jì)需覆蓋切割位點(diǎn)上下游200-500bp),通過Sanger測序或T7E1酶切檢測Indel(插入/缺失突變),或通過限制性酶切(若插入/缺失破壞酶切位點(diǎn))確認(rèn)編輯效果。
三、應(yīng)用場景與注意事項(xiàng)
Z03388系統(tǒng)可用于構(gòu)建疾病模型(如敲除腫瘤抑制基因p53模擬癌癥發(fā)生)、改良作物性狀(如增強(qiáng)水稻抗旱性)、篩選藥物靶點(diǎn)(如敲除耐藥基因驗(yàn)證藥物敏感性)。但需注意脫靶效應(yīng)(可能引發(fā)非目標(biāo)基因突變),建議通過全基因組測序(WGS)評估風(fēng)險(xiǎn);同時(shí),操作需在BSL-2及以上生物安全實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行(若編輯人類致病基因),遵守《基因編輯倫理指南》。
掌握Z03388 GenCrispr Cas9基因編輯系統(tǒng)的原理與操作,能為精準(zhǔn)基因功能研究與生物技術(shù)應(yīng)用提供強(qiáng)大工具,但每一步都需嚴(yán)謹(jǐn)設(shè)計(jì)(從靶點(diǎn)選擇到驗(yàn)證),才能實(shí)現(xiàn)安全、高效的基因編輯。